环境工程学院设环境科学、环境工程、给排水工程、生物工程、建筑环境与能源应用工程五个本科专业。拥有环境工程一级硕士学点和环境工程领域工程硕士学位授予点。环境工程专业2012年全国专业排名省属院校第一。

拥有“教育部工程中心”等科研基地，拥有“武汉方元环保有限股份公司”等产业基地。产学研一体化特色显著。

环境工程学科为湖北省重点学科、湖北省特色学科、建筑环境与设备专业为湖北省品牌专业。

学院拥有一支结构合理、学历层次搞、数学、科研能力强调硕博导师队伍，硕博导师24人，“楚天学者”2人，阳光学者2人，入选国家“百千万人才工程”1人、享受国务院政府特殊津贴专家1人、享受湖北省政府特殊津贴专家3人，湖北省中青年专业称号3人，长期聘请英国专家3人，俄罗斯国家科学院院士1人。在校及毕业硕士研究生近200人，与华中科技大学、东华大学联合培养博士生，研究生深受社会欢迎。

近五年，先后主持承担了包括国家863重大科技专项、国家支撑计划项目、国家自然科学基金项目等在内的102余项；专利50余项、科研经费8500余万元。荣获国家技术发明二等奖2项，教育部科技发明二等奖1项，省部级科技进步奖项9项，省教学成果一等奖1项，出版专著10部。学院拥有现代化专业实验室。